• ​تم وضع الهيكل التنظيمي للمجلس منذ تأسيسه، وقد إستمر العمل بهذا الهيكل حتى العام 2015.
• تم شمول موظفي الأمانة العامة في المجلس بنظام الخدمة المدنية بتاريخ 1/7/2012، ثم تم تحديث الهيكل التنظيمي للمجلس التمريضي الاردني بناء على صدور نظام التنظيم الاداري رقم (27) لسنة 2015 بتاريخ 2015/3/15 مع مراعاة نظام الهياكل التنظيمية في المؤسسات الحكومية الصادر عن وزارة تطوير القطاع العام وبالتعاون مع ديوان الخدمة المدنية.
• يتكون المجلس التمريضي من ثلاث مديريات رئيسية هي: مديرية الشؤون الادارية والمالية، مديرية التطوير والبحث العلمي، و مديرية الاختصاص حيث يتبع كل مديرية عدد من الاقسام الداخلية.   
• وقد كان أبرز معالم الهيكل التنظيمي الجديد هو أنه يظهر الجانب التنظيمي والفني لمهنة التمريض والذي أسس المجلس من أجله من خلال استحداث مديريتين لهذا الشأن وهما مديرية التطوير والبحث العلمي ومديرية الإختصاص.

​